تدور قصة أنمي ورشة عمل قبعة الساحرة (Tongari Boushi no Atelier) حول الفتاة كوكو التي تعيش في عالم مليء بالسحر والتنانين، وتحلم بأن تصبح ساحرة رغم أنها لم تولد بقدرة سحرية. في أنمي ورشة عمل قبعة الساحرة (Tongari Boushi no Atelier) تتغير حياة كوكو عندما تلتقي بساحر غامض، فيكشف لها سرًا خطيرًا عن طبيعة السحر، ويغير نظرتها للعالم بالكامل، لتبدأ رحلتها في فهم هذا العلم الغامض. ومع أحداث أنمي ورشة عمل قبعة الساحرة (Tongari Boushi no Atelier) تدخل كوكو إلى عالم السحرة وتتعلم أسرار السحر خطوة بخطوة، بينما تواجه تحديات واختبارات صعبة تقرّبها من حلمها بأن تصبح ساحرة حقيقية.